Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2IP78347 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2IP78347 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms