Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3M2P53677 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms