Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCP4P48539 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCP4P48539 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCP4P48539 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCP4P48539 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCP4P48539 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCP4P48539 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCP4P48539 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCP4P48539 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCP4P48539 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCP4P48539 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCP4P48539 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCP4P48539 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCP4P48539 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCP4P48539 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCP4P48539 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCP4P48539 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCP4P48539 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCP4P48539 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCP4P48539 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCP4P48539 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCP4P48539 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCP4P48539 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCP4P48539 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCP4P48539 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCP4P48539 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCP4P48539 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCP4P48539 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCP4P48539 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCP4P48539 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCP4P48539 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCP4P48539 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCP4P48539 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCP4P48539 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCP4P48539 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCP4P48539 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCP4P48539 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCP4P48539 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCP4P48539 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCP4P48539 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCP4P48539 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCP4P48539 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCP4P48539 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCP4P48539 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCP4P48539 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCP4P48539 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCP4P48539 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms