Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARSP41250 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GARSP41250 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARSP41250 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARSP41250 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARSP41250 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARSP41250 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARSP41250 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARSP41250 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARSP41250 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GARSP41250 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARSP41250 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARSP41250 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARSP41250 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARSP41250 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARSP41250 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARSP41250 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARSP41250 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARSP41250 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARSP41250 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARSP41250 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARSP41250 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARSP41250 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARSP41250 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARSP41250 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARSP41250 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARSP41250 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARSP41250 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARSP41250 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARSP41250 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARSP41250 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARSP41250 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GARSP41250 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARSP41250 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARSP41250 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARSP41250 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GARSP41250 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GARSP41250 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GARSP41250 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GARSP41250 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GARSP41250 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARSP41250 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARSP41250 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARSP41250 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARSP41250 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARSP41250 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GARSP41250 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARSP41250 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARSP41250 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARSP41250 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARSP41250 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARSP41250 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARSP41250 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARSP41250 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARSP41250 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARSP41250 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARSP41250 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARSP41250 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARSP41250 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARSP41250 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARSP41250 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GARSP41250 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GARSP41250 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GARSP41250 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GARSP41250 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GARSP41250 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GARSP41250 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GARSP41250 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARSP41250 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARSP41250 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARSP41250 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARSP41250 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARSP41250 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARSP41250 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARSP41250 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARSP41250 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GARSP41250 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARSP41250 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARSP41250 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARSP41250 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARSP41250 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GARSP41250 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms