Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ETV3P41162 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETV3P41162 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETV3P41162 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETV3P41162 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETV3P41162 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ETV3P41162 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ETV3P41162 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ETV3P41162 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV3P41162 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV3P41162 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV3P41162 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV3P41162 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV3P41162 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV3P41162 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV3P41162 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV3P41162 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV3P41162 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV3P41162 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV3P41162 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV3P41162 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETV3P41162 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV3P41162 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV3P41162 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV3P41162 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV3P41162 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV3P41162 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV3P41162 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV3P41162 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV3P41162 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV3P41162 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV3P41162 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV3P41162 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETV3P41162 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV3P41162 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV3P41162 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV3P41162 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV3P41162 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV3P41162 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV3P41162 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV3P41162 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV3P41162 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETV3P41162 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV3P41162 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV3P41162 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV3P41162 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV3P41162 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV3P41162 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV3P41162 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV3P41162 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETV3P41162 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETV3P41162 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ETV3P41162 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ETV3P41162 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV3P41162 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV3P41162 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV3P41162 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV3P41162 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV3P41162 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV3P41162 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV3P41162 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV3P41162 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV3P41162 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETV3P41162 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV3P41162 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV3P41162 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV3P41162 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms