Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB4P28070 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB4P28070 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB4P28070 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms