Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA6AP0CW24 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms