Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ITM2AO43736 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITM2AO43736 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms