Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCP110O43303 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCP110O43303 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCP110O43303 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCP110O43303 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCP110O43303 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCP110O43303 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCP110O43303 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCP110O43303 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCP110O43303 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCP110O43303 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCP110O43303 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCP110O43303 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCP110O43303 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCP110O43303 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCP110O43303 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCP110O43303 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCP110O43303 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCP110O43303 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCP110O43303 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCP110O43303 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCP110O43303 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCP110O43303 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCP110O43303 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCP110O43303 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCP110O43303 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCP110O43303 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCP110O43303 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCP110O43303 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCP110O43303 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCP110O43303 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCP110O43303 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCP110O43303 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCP110O43303 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCP110O43303 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCP110O43303 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCP110O43303 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms