Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRRTM2O43300 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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