Protein–RNA interactions for Protein: A6NN73

GOLGA8CP, Golgin subfamily A member 8C, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8CPA6NN73 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA8CPA6NN73 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8CPA6NN73 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms