Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH2D7A6NKC9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms