Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PALM3A6NDB9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALM3A6NDB9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms