Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRP12Q9Y561 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRP12Q9Y561 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms