Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOP58Q9Y2X3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms