Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS9D1Q9Y2B5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1Q9Y2B5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS9D1Q9Y2B5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms