Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11EQ9UL52 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms