Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMIPQ9P107 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMIPQ9P107 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms