Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK12Q9NYV4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK12Q9NYV4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms