Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms