Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3AQ9NVI7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms