Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLCO1B3Q9NPD5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms