Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARS2Q9NP81 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SARS2Q9NP81 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms