Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED9Q9BVK6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED9Q9BVK6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms