Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMM29Q9BSF4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMM29Q9BSF4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms