Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MIPEPQ99797 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms