Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFDN5Q99471 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFDN5Q99471 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms