Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC45A3Q96JT2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC45A3Q96JT2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms