Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC47Q96A33 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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