Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLGN4YQ8NFZ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN4YQ8NFZ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms