Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8N3U1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8N3U1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8N3U1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8N3U1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8N3U1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N3U1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N3U1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N3U1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N3U1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N3U1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N3U1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N3U1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N3U1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N3U1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N3U1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N3U1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8N3U1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N3U1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N3U1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N3U1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N3U1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N3U1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N3U1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N3U1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N3U1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N3U1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N3U1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8N3U1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N3U1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N3U1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N3U1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N3U1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N3U1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N3U1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N3U1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8N3U1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8N3U1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8N3U1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N3U1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N3U1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N3U1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N3U1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N3U1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N3U1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N3U1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N3U1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N3U1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8N3U1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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