Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC30Q5VVM6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC30Q5VVM6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC30Q5VVM6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC30Q5VVM6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms