Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf135Q5VTT2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms