Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9B1Q4ZJI4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149 ms