Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF1Q14990 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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