Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX2Q13950 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX2Q13950 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX2Q13950 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RUNX2Q13950 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX2Q13950 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX2Q13950 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RUNX2Q13950 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX2Q13950 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX2Q13950 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX2Q13950 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNX2Q13950 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RUNX2Q13950 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX2Q13950 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX2Q13950 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX2Q13950 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX2Q13950 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX2Q13950 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX2Q13950 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUNX2Q13950 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RUNX2Q13950 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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