Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH18Q13634 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH18Q13634 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
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