Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCGB2A2Q13296 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCGB2A2Q13296 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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