Protein–RNA interactions for Protein: Q12788

TBL3, Transducin beta-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBL3Q12788 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBL3Q12788 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBL3Q12788 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms