Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREMQ03060 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREMQ03060 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREMQ03060 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREMQ03060 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREMQ03060 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CREMQ03060 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREMQ03060 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREMQ03060 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CREMQ03060 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREMQ03060 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREMQ03060 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREMQ03060 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREMQ03060 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREMQ03060 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREMQ03060 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREMQ03060 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREMQ03060 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREMQ03060 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREMQ03060 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREMQ03060 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREMQ03060 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREMQ03060 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREMQ03060 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREMQ03060 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREMQ03060 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CREMQ03060 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREMQ03060 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CREMQ03060 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREMQ03060 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREMQ03060 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREMQ03060 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREMQ03060 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREMQ03060 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREMQ03060 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREMQ03060 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREMQ03060 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREMQ03060 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREMQ03060 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREMQ03060 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREMQ03060 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CREMQ03060 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREMQ03060 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREMQ03060 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREMQ03060 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREMQ03060 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREMQ03060 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREMQ03060 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREMQ03060 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREMQ03060 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREMQ03060 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREMQ03060 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREMQ03060 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREMQ03060 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREMQ03060 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREMQ03060 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREMQ03060 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms