Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD1Q02809 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLOD1Q02809 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD1Q02809 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms