Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POU5F1Q01860 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POU5F1Q01860 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms