Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP107P57740 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP107P57740 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP107P57740 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP107P57740 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP107P57740 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP107P57740 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP107P57740 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP107P57740 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NUP107P57740 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP107P57740 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP107P57740 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP107P57740 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP107P57740 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP107P57740 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP107P57740 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP107P57740 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP107P57740 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP107P57740 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP107P57740 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP107P57740 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP107P57740 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP107P57740 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP107P57740 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP107P57740 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP107P57740 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP107P57740 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP107P57740 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP107P57740 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP107P57740 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP107P57740 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP107P57740 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP107P57740 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP107P57740 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP107P57740 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP107P57740 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP107P57740 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP107P57740 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP107P57740 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP107P57740 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP107P57740 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP107P57740 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP107P57740 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP107P57740 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms