Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP11P51784 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP11P51784 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP11P51784 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP11P51784 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP11P51784 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP11P51784 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP11P51784 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP11P51784 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP11P51784 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP11P51784 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP11P51784 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP11P51784 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP11P51784 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP11P51784 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP11P51784 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP11P51784 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP11P51784 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP11P51784 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP11P51784 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP11P51784 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP11P51784 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP11P51784 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP11P51784 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP11P51784 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP11P51784 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP11P51784 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP11P51784 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP11P51784 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP11P51784 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP11P51784 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP11P51784 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP11P51784 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP11P51784 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP11P51784 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP11P51784 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP11P51784 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP11P51784 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP11P51784 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP11P51784 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP11P51784 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP11P51784 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP11P51784 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP11P51784 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP11P51784 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP11P51784 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP11P51784 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP11P51784 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP11P51784 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP11P51784 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP11P51784 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP11P51784 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP11P51784 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP11P51784 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP11P51784 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP11P51784 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP11P51784 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP11P51784 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP11P51784 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP11P51784 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP11P51784 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP11P51784 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP11P51784 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP11P51784 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP11P51784 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP11P51784 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP11P51784 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP11P51784 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP11P51784 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP11P51784 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP11P51784 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP11P51784 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP11P51784 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP11P51784 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP11P51784 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP11P51784 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP11P51784 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP11P51784 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP11P51784 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP11P51784 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP11P51784 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP11P51784 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms