Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCR3P49682 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR3P49682 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR3P49682 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms