Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHKA1P46020 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHKA1P46020 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHKA1P46020 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms