Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD10P28358 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms