Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2F2P24468 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR2F2P24468 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR2F2P24468 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR2F2P24468 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2F2P24468 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2F2P24468 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2F2P24468 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2F2P24468 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2F2P24468 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2F2P24468 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2F2P24468 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2F2P24468 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms