Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGA1P17096 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA1P17096 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms