Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM1P13164 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms